Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q8BGC1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8BGC1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q8BGC1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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