Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-M10.5Q85ZW7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms