Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms