Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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