Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed4Q80WQ9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms