Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ1

Ggn, Gametogenetin, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GgnQ80WJ1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GgnQ80WJ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GgnQ80WJ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms