Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AknaQ80VW7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms