Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ntf4Q80VU4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ntf4Q80VU4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms