Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lamp3Q7TST5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lamp3Q7TST5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms