Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnkQ7TSL0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms