Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp6r1Q7TSI3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp6r1Q7TSI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms