Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1bQ7TSF1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1bQ7TSF1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms