Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LnpkQ7TQ95 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LnpkQ7TQ95 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms