Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prrc2bQ7TPM1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prrc2bQ7TPM1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms