Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd3eapQ76KJ5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd3eapQ76KJ5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms