Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2r2Q6ZWZ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms