Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl35Q6ZWV7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms