Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Syne1Q6ZWR6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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