Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RfflQ6ZQM0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RfflQ6ZQM0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms