Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ncapd3Q6ZQK0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms