Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80Q6ZPV2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ino80Q6ZPV2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms