Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shc4Q6S5L9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms