Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptx4Q6RUU0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms