Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5C6

Gm10277, Predicted gene 10277, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10277Q6R5C6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10277Q6R5C6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms