Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nudcd1Q6PIP5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms