Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med16Q6PGF3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med16Q6PGF3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms