Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff1Q6PFE7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff1Q6PFE7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff1Q6PFE7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff1Q6PFE7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmeff1Q6PFE7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmeff1Q6PFE7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmeff1Q6PFE7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmeff1Q6PFE7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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