Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrt3Q6PE13 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt3Q6PE13 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt3Q6PE13 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt3Q6PE13 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrt3Q6PE13 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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