Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Taf1cQ6PDZ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf1cQ6PDZ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms