Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vstm2lQ6PDS0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vstm2lQ6PDS0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms