Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms