Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RgmaQ6PCX7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RgmaQ6PCX7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms