Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkab2Q6PAM0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkab2Q6PAM0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms