Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smarcd3Q6P9Z1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms