Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn7Q6P5G6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn7Q6P5G6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn7Q6P5G6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn7Q6P5G6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubxn7Q6P5G6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms