Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2aQ6P4T0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms