Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Slx4Q6P1D7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx4Q6P1D7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms