Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Soga3Q6NZL0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Soga3Q6NZL0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms