Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HelbQ6NVF4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HelbQ6NVF4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms