Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ParpbpQ6IRT3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms