Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw2Q6I6G8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw2Q6I6G8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms