Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scaf8Q6DID3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scaf8Q6DID3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms