Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PnkdQ69ZP3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnkdQ69ZP3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms