Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk13Q69ZA1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk13Q69ZA1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms