Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brsk2Q69Z98 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brsk2Q69Z98 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms