Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CilpQ66K08 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms