Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrc8eQ66JT1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms