Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Top2bQ64511 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2bQ64511 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms