Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn1Q64347 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn1Q64347 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn1Q64347 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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Clcn1Q64347 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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Clcn1Q64347 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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Clcn1Q64347 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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Clcn1Q64347 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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Clcn1Q64347 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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Clcn1Q64347 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn1Q64347 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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Clcn1Q64347 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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