Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Surf4Q64310 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Surf4Q64310 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms